Using R to draw Heatmap

#1 heatmap

R绘图基础(四)热图 heatmap

#2 heatmap.2 【需要安装gplots包】

https://www.r-bloggers.com/r-heatmaps-with-gplots/

#3 d3heatmap 【可以生成Web交互图】

d3heatmap: Interactive heat maps

#4 pheatmap 【全称pretty heatmap,生成的图片比较好看】

http://blog.sciencenet.cn/blog-1334016-932200.html

#5 ggplot2

https://learnr.wordpress.com/2010/01/26/ggplot2-quick-heatmap-plotting/

#6 ComplexHeatmap

可以对热图进行2D的注释,绘制用于注释的框线图、曲线图等。

再论热图 (heatmap)

#7 heatmap3

可以对heatmap的每一个单元格做出特殊的标记,并且对行和列加上2D的基本注释图像

#8 heatPlus

可以对行和列进行多种不同数据类型的注释,也就是说对行或者列可以绘制2D的基本注释图像,比如说曲线,点图,以及histograms等

#9 heatmaply

heatmaply是基于plotly的热图包。plotly.js 是一个基于javascript的强大的交互绘图包。

#10 fields

 

#11

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