博客归档

根据参考基因组对contigs进行排列

Multiple programs have been developed fo

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基因组序列的共线性分析

1 LASTZ Ref:http://www.bx.psu.edu/miller

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SSPACE: Can’t locate getopts.pl

问题:运行SSPACE_Standard_v3.0.pl报错。 Can&#821

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Shell编程:获取文件前缀字符串

比如处理名为 /xxx/yyy/zzz/abc2017.1.fq.gz 的文件,

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Shell脚本 “set Illegal option -o pipefail”

在Linux编写Shell 脚本程序的时候,set -o pipefail是很实

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Infernal和hmmer程序的安装

再Rfam数据库对small RNA进行注释的过程中需要用到Infernal,但

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基因组|N50与N90的统计

背景 基因组组装的过程中,N50与N90是常用的评价指标。 方法 可以使用NGS

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